要做好网站的自然优化，需要注意以下几个问题：
1.网站内容质量：优秀的内容是吸引用户和搜索引擎关注的重要因素。网站内容应该是原创、有用、丰富、独特的，而不是复制或者抄袭其他网站的内容。同时，网站内容应该是用户友好的，易于阅读和理解。
2.关键词优化：关键词是用户在搜索引擎中查找信息的关键。因此，在网站中需要针对关键词进行优化，包括合理的关键词密度、标题、描述、URL等等。
3.内部链接：合理的内部链接可以提高网站的内部链接关系，让搜索引擎更好地了解网站的结构和内容，提高网站的权威性和信任度。同时，内部链接也可以帮助用户更好地浏览网站内容。
4.网站结构优化：网站的结构应该清晰明了，易于搜索引擎和用户理解。网站结构应该是扁平化的，不要有太多的层级关系。
5.网站性能优化：网站的性能也是影响自然优化的重要因素。网站需要保证快速的加载速度、良好的用户体验，同时也需要保证网站的安全性和稳定性。
6.外部链接：外部链接是提高网站权威性和信任度的重要因素。因此，建立高质量的外部链接是提高网站自然优化效果的关键。但是需要注意的是，外部链接应该是自然的，避免使用一些非法或者不可靠的手段来获得外部链接。
综上所述，要做好网站的自然优化，需要综合考虑上述几个问题，尽可能地提高网站的质量和用户体验。
